куча дублей

не для кого не секрет что яндекс фильтрует за дубли

как бороться с такими ссылками?
index.php/hgfjh/nbvmnbm/forum/forum/fdsfdsfdsf/index.php

по таким ссылкам все модули работают

Ну так не создавайте таких ссылок. Откуда они у вас берутся?

да кто этих ботов знает как они их находят
еще и дизайн съезжает и ссылки постоянно a href=index
почему разработчик цмс ки не ставил слешей? сколько версий уже прошло а старая ошибка все еще осталась

начал писать ЧПУ /account/ index.php?name=Account
дизайн конечно же съехал, начал исправлять пути, потом оказалось что и модули правлять нужно

начал писать ЧПУ /account/

Для ЧПУ вида: www.example.com/catalog/ используй: base href, тогда никаких путей править не нужно будет...